Archive for

Spotted



September 18, 2018

JSTOR Text Analyzer

By Richard Broekman

Spotted_small

[English text below]

(Dit is een bijdrage in de serie Spotted. Reacties zijn uiteraard zeer welkom.)

JSTOR Text Analyzer uploadUpload een artikel in JSTOR’s Text Analyzer en je krijgt suggesties voor gerelateerde artikelen en een lijst trefwoorden om verder mee te zoeken.

Bij het zoeken naar nieuwe literatuur ga je vaak uit van artikelen die je al eerder hebt gevonden. Je kijkt naar de referenties en termen die zijn gebruikt. Afhankelijk van de database waarin je zoekt zie je mogelijk welke artikelen het gevonden artikel citeren en welke gerelateerde artikelen te vinden zijn.

Hoe werkt het?

Met de bèta versie van JSTOR Text Analyzer zoek je op een andere manier. Bij de Text Analyzer upload je zelf een tekst vanaf je computer of telefoon. De tekst van het document wordt geanalyseerd en je krijgt direct als resultaat een lijst artikelen die vergelijkbare onderwerpen behandelen. De service werkt met een groot aantal bestandsformaten, waaronder docx (Word), pdf en afbeeldingen. Maak een foto van een pagina met je telefoon en laat die analyseren. JSTOR Text Analyzer ResultsDoor middel van OCR en Natural Language Processing wordt tekst uit documenten geïnterpreteerd en vertaald naar zoektermen zoals onderwerpen (topics) en namen. Vervolgens wordt in JSTOR gezocht naar publicaties waarin een of meer van deze termen voorkomen. Je kunt zelf termen toevoegen of verwijderen, gewicht toekennen aan termen en filteren op jaren en soort publicatie. Elke wijziging wordt meteen verwerkt en het gevolg van het aanpassen is dus direct duidelijk.

Welke tijdschriften?

Uiteraard wordt alleen gezocht naar artikelen in JSTOR. Niet alle gevonden publicaties zijn beschikbaar onder ons abonnement op JSTOR. Je kunt ervoor kiezen om resultaten te filteren zodat alleen content wordt getoond die ook daadwerkelijk beschikbaar is binnen ons abonnement. Hiervoor is het wel nodig dat je op de campus of via VPN werkt.

Wanneer te gebruiken?

Hoewel het op dit moment nog geen vervanging is voor een gedegen eigen analyse en strategie, levert deze aanpak wel snel een aantal suggesties. Dit kan helpen bij het inlezen in het onderwerp, om vervolgens een eigen strategie te bepalen. Doordat het systeem teksten in 15 talen kan analyseren, is het bruikbaar om bijvoorbeeld op basis van een Nederlandse tekst anderstalige publicaties of trefwoorden te vinden. Deze zijn eventueel ook te gebruiken bij zoekacties in andere bestanden.

Zelf proberen?

Ga direct naar JSTOR’s Text Analyzer en probeer het uit.

English

Category: Spotted

February 9, 2018

Utopia Documents pdf reader

By Richard Broekman

[English text below]

Spotted_small(Dit is een bijdrage in de serie Spotted. Reacties zijn uiteraard zeer welkom.)

Utopia Documents is een gratis en open source pdf reader met extra functionaliteit op het gebied van altmetrics, commentaar en discovery. Er zijn versies voor Windows, Mac en Linux.

Utopia Documents screenshotPdf’s worden desgewenst opgeslagen in een eigen library, met onderverdeling in collecties. Er is een mogelijkheid om direct vanuit de applicatie documenten online te zoeken, maar dit werkt momenteel alleen voor PubMed.

Er zijn aparte toolbars voor het bladeren door pagina’s en voor het bladeren door figuren. De toolbar voor figuren toont een overzicht van alle figuren die in de tekst voorkomen. Scrollen door de figuren gaat eenvoudig en door een figuur aan te klikken spring je direct naar de pagina in de tekst waar de figuur op voorkomt.

De kracht van Utopia zit vooral in de extra informatie die wordt getoond in de ‘evaluate’ sidebar:

  • Utopia herkent automatisch de documentstructuur (hoofdstukindeling) en presenteert een overzicht hiervan.
  • Bij een document wordt de altmetrics score getoond, met een link naar altmetric.com zodat je aanvullende informatie en vermeldingen kunt bekijken.
  • Indien beschikbaar worden downloadcijfers getoond. (Dit is afhankelijk van de ondersteuning van de applicatie door de service waar de full text is opgeslagen.)
  • Er wordt informatie over archivering en gebruik getoond uit de Sherpa/RoMEO database.
  • Voor elke pdf wordt een citatie aangemaakt in een te kiezen stijl (bijvoorbeeld APA en MLA). Het is mogelijk om citations te exporteren als BibTeX.
  • Er kan commentaar worden toegevoegd. (Hiervoor moet je wel een account aanmaken.)
  • Tekst is te selecteren en vervolgens op te zoeken in Google of andere algemene services. Met de Explore optie wordt geselecteerde tekst opgezocht in een aantal geselecteerde services, zoals bijvoorbeeld Wikipedia, maar ook subject-specifieke services.

Het is mogelijk om plug-ins te activeren voor Utopia Documents. De meest interessante is Lazarus. Om deze te activeren moet je het delen van anonieme gebruiksdata toestaan.

De Lazarus plug-in:

  • Toont een bibliografie voorzien van links naar zoekactie in Google Scholar om de documenten uit de bibliografie te vinden.
  • Analyseert doorzoekt de pdf naar ‘expressions’. Dit zijn stukjes tekst over concepten die vervolgens worden vergeleken met teksten in andere publicaties. Teksten die overeenkomende concepten bevatten worden getoond en kunnen direct in Utopia worden geopend.

Volgens de documentatie werkt de extra functionaliteit op dit moment vooral goed “in the life sciences; molecular biology, chemistry, bioinformatics”. De functionaliteit blijkt ook redelijk te werken met publicaties uit vakgebieden die relevant zijn voor Tilburg University. Vooral de weergave van altmetrics informatie en het opzoeken van titels uit de bibliografie.

English

Category: Spotted

December 1, 2017

Kudos: eenvoudig beschreven onderzoeken

By Richard Broekman

[English text below]

(Dit is een bijdrage in de serie Spotted. Reacties zijn uiteraard zeer welkom.)

kudos-logo-smallHet doel van Kudos is het bereik van publicaties te vergroten door ze op een meer toegankelijke wijze te beschrijven. Je beschrijft je publicatie niet zozeer voor andere wetenschappers die toevallig binnen hetzelfde onderzoeksgebied werken, maar voor bijvoorbeeld een journalist, iemand uit een aangrenzend vakgebied of een geïnteresseerde leek.

Bij Kudos kun je als auteur een profiel aanmaken en eigen publicaties ‘claimen’. Voor elke publicatie wordt dan een bijbehorende profielpagina aangemaakt. Je beschrijft vervolgens de publicatie in ‘lekentermen’ op drie onderdelen: What’s it about, Why is it important en Perspectives. Zo geef je een eenvoudige vertaling van de kern van het artikel waarmee ook een niet-expert de kern van het onderzoek begrijpt. Naast de drie beschrijvingen kun je links naar extra informatie toevoegen.

Elke publicatie krijgt een speciale URL voor de profielpagina die je vervolgens kunt delen op social media e.d. Wil je het artikel onder de aandacht brengen op Twitter of Facebook, gebruik dan deze URL. Het gebruik van die URL wordt bijgehouden in metrics (o.a. aantal keren gedeeld, bekeken op Kudos, doorgeklikt naar full text, altmetric score en geciteerd in Web of Science). Dit alles is beschikbaar in een dashboard voor de auteur.

Het is mogelijk om widgets te krijgen van de samenvattingen die je elders kunt integreren, bijvoorbeeld op je persoonlijke webpagina. Een denkbare toepassing is bijvoorbeeld ook om zo’n widget te gebruiken bij persberichten.

Het gebruik van Kudos maakt het onderzoek toegankelijker, wat het bereik ervan vergroot. De verschillende metrics die worden bijgehouden tonen de auteur hoe groot het bereik is. Helaas betekent het gebruik van Kudos wel weer een extra site om bij te houden. Er is nog geen integratie met bijvoorbeeld Pure. Uiteraard kun je in Pure wel een eigen abstract toevoegen in toegankelijke termen.

Een goed voorbeeld van het gebruik van Kudos is de beschrijving van Bubbles: towards a typology . De bijbehorende pagina bij Emerald toont de integratie van de widget.

English

Category: publishing, Spotted

November 1, 2017

Overzicht van reviewactiviteiten via Publons

By Richard Broekman

[English text below]

Spotted_small(Dit is een bijdrage in de serie Spotted. Reacties zijn uiteraard zeer welkom.)

Publons is een service waarbij wetenschappers hun peer review werk kunnen registreren en etaleren. Publons is opgericht in 2013 en is sinds kort onderdeel van Clarivate Analytics.

PublonsProfilePageReviewers maken een account aan op Publons en krijgen daarmee een eigen profielpagina. Naast een korte biografie kun je bijvoorbeeld opnemen op welke onderzoeksgebieden je actief bent, van welke editorial boards je eventueel deel uitmaakt en voor welke tijdschriften je reviewt. Vervolgens kun je reviewactiviteiten toevoegen aan je account. Dit kan op verschillende manieren. De twee belangrijkste zijn via deelnemende uitgevers, waarbij de reviewer tijdens het reviewproces ervoor kan kiezen de review toe te voegen aan diens Publons-account, of via e-mail, waarbij de reviewer bewijs van de reviewwerkzaamheden mailt. Publons verifieert dat vervolgens bij de uitgever.

Wanneer reviewactiviteiten eenmaal zijn toegevoegd aan een profiel kun je er als reviewer voor kiezen om statistieken hierover publiek te maken of privé te houden.  De reviews tellen sowieso mee voor altmetric scores. Reviewers met een ORCID kunnen ervoor kiezen om Publons en ORCID te synchronizeren, waardoor de reviews ook in ORCID bekend zijn. Behalve informatie over de reviewactiviteiten kunnen ook de reviews zelf (dus de teksten) op Publons worden geplaatst. Een en ander eventueel afhankelijk van de voorwaarden van het tijdschrift waarvoor de review is uitgevoerd.

Verschillende activiteiten binnen Publons, zoals het plaatsen van reviews en het door anderen laten endorsen van reviews, leveren zogenaamde merits op. De Publons Merit score geeft dan de mate van activiteit als reviewer aan.

Er is een overzicht van alle reviewers met Tilburg University als affiliatie.

English

Category: publishing, Spotted

October 31, 2017

Nieuwe rubriek: Spotted

By Richard Broekman

[English text below]

Spotted image Op 1 november starten we met een nieuwe serie artikelen. In de serie Spotted plaatsen we berichten over zaken die ons zijn opgevallen en die mogelijk interessant zijn voor onderzoekers. Het gaat om diensten en toepassingen die momenteel niet tot de dienstverlening van de Library and IT Services behoren, maar die in principe door iedereen individueel te gebruiken zijn. Het doel van deze serie is tweeledig. We willen onderzoekers die deze services nog niet kennen informeren over het bestaan ervan. Van onderzoekers die de services al wel kennen horen we graag wat zij ervan vinden. Wat zijn hun ervaringen, waarom gebruiken zij het of waarom gebruiken zij het juist niet (meer)?

Een paar opmerkingen over de onderwerpen van Spotted:

  • Library and IT Services ondersteunt in principe niet bij het gebruik van de service of tool. Er is geen licentie afgesloten en er zijn geen afspraken gemaakt met de aanbieder over bijvoorbeeld privacy. Lees dus altijd goed de voorwaarden voordat je eventueel als individu besluit gebruik te maken van de service.
  • De beschrijving van de service is vooral bedoeld om een algemeen beeld te geven. Wij zijn geen deskundigen, maar gaan af op wat we zelf hebben geprobeerd of waarover we hebben gelezen.
  • Heb je ervaring met de beschreven service, dan horen we dat graag. Zowel positieve als negatieve ervaringen zijn welkom, omdat dit ons kan helpen bij het al dan niet aanbevelen van de service aan andere onderzoekers. Reageren kan via het weblog of via mail.
  • Tips over services zijn altijd welkom. Ben je zelf onderzoeker of ondersteuner bij Tilburg University en wil je ons tippen, neem dan contact op met Richard Broekman.

English version

Category: Spotted

Recent Posts

Categories

Archives

About

Posts on research data management, open access publishing, copyright, and access to scientific information. For Tilburg University researchers - by the Research Support department of Library and IT Services. Read More